Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EFNA2O43921 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA2O43921 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms