Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HTATSF1O43719 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms