Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRC1O43663 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRC1O43663 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRC1O43663 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRC1O43663 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRC1O43663 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRC1O43663 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRC1O43663 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRC1O43663 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRC1O43663 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRC1O43663 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRC1O43663 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRC1O43663 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRC1O43663 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms