Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP2A1O14983 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2A1O14983 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms