Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEURL1BA8MQ27 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms