Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PALM3A6NDB9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM3A6NDB9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms