Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37CA5D8V6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms