Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRP5LA4QPB2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LRP5LA4QPB2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms