Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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