Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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