Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OLMALINC-206ENST00000641799 1195 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AF127936.2-201ENST00000455253 1724 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 C14orf2-201ENST00000286953 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FCAR-202ENST00000353758 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 BPNT1-202ENST00000354807 1152 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP239-201ENST00000364814 295 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 S100A8-202ENST00000368733 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AIF1-203ENST00000376059 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MIR711-201ENST00000390201 76 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ARF1P1-201ENST00000406466 544 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00630-202ENST00000420471 838 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL023773.1-201ENST00000423985 1124 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC079355.2-201ENST00000440057 190 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HIPK1-AS1-203ENST00000441071 571 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP000561.1-201ENST00000444130 435 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC096915.1-201ENST00000456185 512 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC084871.2-201ENST00000503355 464 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC109811.2-201ENST00000509609 452 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC010457.1-202ENST00000510137 337 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC103855.2-202ENST00000527642 568 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MYL6-207ENST00000547649 655 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SRP14-205ENST00000559081 578 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms