Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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PDK4Q16654 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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PDK4Q16654 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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PDK4Q16654 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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PDK4Q16654 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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PDK4Q16654 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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PDK4Q16654 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PDK4Q16654 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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