Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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SP140Q13342 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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