Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
DUSP4Q13115 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
DUSP4Q13115 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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