Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPN13Q12923 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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