Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BPTFQ12830 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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