Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR10J9P-201ENST00000511932 987 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms