Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 SLC30A8-208ENST00000521243 1393 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 VSIG1-202ENST00000415430 3236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 OR4D6-201ENST00000300127 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RNA5SP297-201ENST00000391029 113 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 STAT2-202ENST00000418572 1548 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 LINC01125-248ENST00000627284 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SH3BP2P78314 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms