Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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