Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CEP290O15078 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CEP290O15078 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CEP290O15078 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CEP290O15078 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CEP290O15078 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CEP290O15078 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CEP290O15078 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CEP290O15078 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CEP290O15078 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CEP290O15078 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms