Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CIPCQ9C0C6 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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