Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RNF17Q9BXT8 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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RNF17Q9BXT8 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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RNF17Q9BXT8 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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RNF17Q9BXT8 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RNF17Q9BXT8 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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