Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 POLD3-201ENST00000263681 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIP-201ENST00000257979 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NFKB1-205ENST00000505458 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MARCH7-209ENST00000539065 3303 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC024132.1-201ENST00000382007 2509 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 L3MBTL3-204ENST00000526019 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NRF1-203ENST00000353868 3568 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 E2F8-205ENST00000620009 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104699.1-201ENST00000352271 414 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP134-201ENST00000363960 269 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LYG2-203ENST00000409679 878 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GNLY-202ENST00000409696 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL096701.1-201ENST00000445477 457 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL292P-201ENST00000473305 266 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022679.1-201ENST00000522559 496 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms