Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CAVIN4Q5BKX8 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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