Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 OR7E83P-201ENST00000511021 970 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 S100Z-201ENST00000317593 1468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 OR7E11P-202ENST00000642027 1491 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B3-AS1-201ENST00000448857 1072 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC093074.1-201ENST00000590280 556 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
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