Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USF2Q15853 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
USF2Q15853 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
USF2Q15853 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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