Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
R3HDM1Q15032 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms