Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RAB39AQ14964 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RAB39AQ14964 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms