Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms