Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 GABRA4-201ENST00000264318 11973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CABYR-202ENST00000399481 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CCT5P1-201ENST00000502314 1618 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TJAP1-215ENST00000612912 4312 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ANKRD20A11P-206ENST00000451663 3717 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 C7orf71-201ENST00000409974 1956 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ATP7B-215ENST00000634844 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RNA5-8SP2-201ENST00000363564 152 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC005999.1-201ENST00000414409 588 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL008638.1-201ENST00000430468 473 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CASP1-204ENST00000525825 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AP002892.2-201ENST00000544195 560 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC018448.2-201ENST00000548295 305 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 COX5AP2-201ENST00000554418 394 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 VWA3A-205ENST00000563755 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 AP000787.3-201ENST00000634407 307 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 IL5RA-206ENST00000430514 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 ZNF185-202ENST00000318529 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 COL21A1-201ENST00000244728 4339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 CD36-214ENST00000447544 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL137793.1-201ENST00000433734 599 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
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MKRN4PQ13434 RN7SL659P-201ENST00000483093 299 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LINC02330-201ENST00000557784 555 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC005552.1-201ENST00000577556 662 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC103810.2-201ENST00000577938 559 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC005828.5-201ENST00000582741 355 ntTSL 4 BASIC9.91□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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