Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SRSF5Q13243 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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