Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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CHAF1BQ13112 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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CHAF1BQ13112 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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CHAF1BQ13112 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1BQ13112 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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