Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
CHAF1AQ13111 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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