Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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GRIK2Q13002 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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GRIK2Q13002 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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GRIK2Q13002 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GRIK2Q13002 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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GRIK2Q13002 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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GRIK2Q13002 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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GRIK2Q13002 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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GRIK2Q13002 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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GRIK2Q13002 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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GRIK2Q13002 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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GRIK2Q13002 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GRIK2Q13002 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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