Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms