Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RPL18AP7-201ENST00000435924 524 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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HOXD11P31277 OPRM1-209ENST00000435918 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 CLIP1-203ENST00000361654 5568 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ERC1-225ENST00000611180 2832 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ZFAT-208ENST00000520356 4273 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ZNF141-201ENST00000240499 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 TECPR2-201ENST00000359520 8686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 ZNF185-209ENST00000449285 4328 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 MUSK-201ENST00000189978 2408 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HOXD11P31277 MUSK-204ENST00000374440 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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