Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.4 ms