Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP18Q9UMW8 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms