Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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