Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 KCND3-AS1-202ENST00000427471 583 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TOP3AQ13472 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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