Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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IFT88Q13099 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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IFT88Q13099 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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IFT88Q13099 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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