Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
TRAF1Q13077 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms