Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MAPK10-248ENST00000640490 2715 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC092329.4-202ENST00000638174 1989 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 HKR1-202ENST00000392153 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC011747.1-201ENST00000425678 565 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RPSAP49-201ENST00000445182 886 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LINC01015-204ENST00000445296 399 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SSU72P8-201ENST00000473520 585 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PRR27-202ENST00000502294 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ISX-201ENST00000308700 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SLFN12-206ENST00000452764 2423 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ARHGEF9-234ENST00000637557 4775 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RAD9B-203ENST00000409246 2794 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SRSF10-207ENST00000453840 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL359924.1-201ENST00000450451 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ZNF195-230ENST00000620374 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 C2orf91-201ENST00000378711 3721 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 DDIAS-211ENST00000533655 3533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CCNYL3-201ENST00000407030 998 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL357127.1-201ENST00000451295 438 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 NBPF2P-201ENST00000453025 661 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
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