Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SREBF2Q12772 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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