Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD10P28358 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD10P28358 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms