Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
PTPRGP23470 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
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