Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
VPREB1P12018 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms