Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms