Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 DNM1P47-201ENST00000560757 334 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC104117.5-201ENST00000606195 547 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 SMR3A-201ENST00000226460 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 RPS3A-201ENST00000274065 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 PDE4DIP-241ENST00000616206 874 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
LINC00587B1AMM8 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms