Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
C4orf47A7E2U8 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms